Sanja Jovanović (geboren am 15. September 1986 in Dubrovnik) ist eine Rückenschwimmerin aus Kroatien, die ihr olympisches Debüt für ihr Heimatland bei den Olympischen Sommerspielen 2004 in Athen, Griechenland, gab. Dort trat sie im 100-m- und 200-m-Rückenschwimmen an, wo sie den 17. und 13. Platz belegte. Sie nahm auch an den Olympischen Spielen in Peking 2008 und in London 2012 teil. Am 13. April 2008 brach sie bei den Kurzbahn-Europameisterschaften im Schwimmen den Weltrekord im 50-Meter-Rückenschwimmen und verbesserte damit ihren am 15. Dezember 2007 aufgestellten Rekord. Sie gewann die nationale Meisterschaft mehrere Male und hält den nationalen Rekord.